这部电影是伊娃新的戏剧三部曲的第三部。14年前,号角疑似神化的第一形态的觉醒,带来了近三次冲击,引起了世界前所未有的变化。之后,三户葛城和其他NERV旧部离开,成立了抵抗西乐和NERV的WilleWille,命令明日香和李珍夺回被封在卫星轨道上的horn和Shinji Ikari,但绝对禁止Shinji登上horn,感受周围的敌意。无知的真嗣跟随绫波丽登上了突如其来的入侵。 在这里,他意外地与思念已久的凌波重逢,并从父亲那里得知,他将与美国少年大坂嘉吾(Kaworu Nagisa)一起驾驶第十三架飞机。 有14年的空白,其间的沧桑和感情纠葛让真嗣不知所措。 而看似温和的大坂嘉务为他揭开了种种不可思议的真相...